Построение оптимальной иммунносетевой модели на основе модифицированного алгоритма роя частиц

Journal of Mathematics Mechanics and Computer Science, 2018

Full text Open access: Gold Metadata (CSL-JSON)
DOI 10.26577/jmmcs-2018-2-402
Data confidence 70 medium
How this score is calculated

It is built from checkable properties of the record itself: whether the article has a DOI, how many independent sources confirmed its data, whether the required fields are filled in, and how recent the latest confirmation is. Disagreement between sources and a missing identifier lower it. A value of 80 or above means the record was published without further checking; 60 to 79 means it is published at reduced confidence, with a manual check advisable. A record verified by an editor by hand is never pushed below 90 by a recalculation. This scores our data about the article, not the article itself.

Abstract

Разработка информационных технологий на основе биоинспирированных интеллектуальных методов, например подхода искусственных иммунных систем, для компьютерного молекуляр- ного дизайна новых лекарственных препаратов и прогнозирования зависимости "структура- свойство/активность"(QSAR) химических соединений является актуальной проблемой. Ста- тья посвящена решению задачи QSAR по построению иммунносетевой модели на основе вы- бора оптимального набора дескрипторов для облегчения процесса отбора новых химических соединений в кандидаты лекарственных препаратов с заданными свойствами. В соответствии с концепцией мультиалгоритмического подхода разработка оптимальной иммунносетевой мо- дели и выделение информативных дескрипторов осуществляется на основе алгоритмов роя частиц. В данной работе описано сравнение классического алгоритма роя частиц (PSO) и модифицированного алгоритма роя частиц с весом инерции (IWPSO) для отбора информа- тивных дескрипторов на примере лекарственных соединений сульфаниламидной группы с различной фармакологической активностью. Проанализирован выбор параметров (фитнес- функций, размер популяций, количество итераций и др.), определяющих эффективность ра- боты предложенных алгоритмов для построения оптимального набора дескрипторов. Приве- дены результаты моделирования зависимости значений фитнес-функций от количества ите- раций в программных продуктах WEKA и Yarpiz (PSO).