Abstract
Influenza A virus remains one of the most formidable respiratory threats, with hemagglutinin (HA) playing a pivotal role in pathogenesis by mediating critical conformational rearrangements required for the fusion of viral and cellular membranes. Molecular docking-based positioning has emerged as a vital tool for evaluating the potential biological activity of compounds targeting viral proteins. In the present study, a structural and biological analysis of the molecular interactions between polyene polyketides and influenza A (H5) HA was conducted using the Protein-Ligand Interaction Profiler (PLIP) for automated contact annotation. A panel of 20 polyene compounds, including fungimycin, hamycin, amphotericin B, levorin, natamycin, and filipin, was investigated. It was demonstrated that the most active compounds exhibit a high capacity for forming multiple hydrogen bonds (4–9 per complex) and hydrophobic interactions with key amino acid residues, specifically LYS266A, ASN81B, LYS82B, and LEU297A, located within the stem region of HA. Binding energies ranged from –6.2 to –10.8 kcal/mol. The localization of polyenes at the HA1–HA2 subunit interface suggests a potential ability to block pH-dependent conformational transitions, which are critically important for the viral-cell membrane fusion process. Вирус гриппа А остается одной из наиболее серьезных респираторных угроз, при этом ключевую роль в патогенезе играет гемагглютинин (HA), опосредующий критические конформационные перестройки для слияния вирусной и клеточной мембран. Молекулярное позиционирование с использованием метода докинга становится важным инструментом для изучения потенциальной биологической активности соединений против вирусных белков. В данном исследовании проведён структурно-биологический анализ молекулярных взаимодействий полиеновых поликетидов с HA вируса гриппа A (H5) с применением Protein-Ligand Interaction Profiler (PLIP). Исследована панель из 20 полиеновых соединений, включая фунгимицин, хамицин, амфотерицин B, леворин, натамицин и филипин. Показано, что наиболее активные соединения демонстрируют высокую способность к образованию множественных водородных связей (4–9 на комплекс) и гидрофобных взаимодействий с ключевыми аминокислотными остатками LYS266A, ASN81B, LYS82B и LEU297A в стеблевой области HA. Энергии связывания варьировали от –6.2 до –10.8 ккал/моль. Локализация полиенов в интерфейсе субъединиц HA1–HA2 указывает на потенциальную способность блокировать pH-зависимые конформационные перестройки, критически важные для процесса слияния вирусной и клеточной мембран.