EXPLORING THE ASSOCIATION OF VITAMIN D RECEPTOR GENE VARIANTS AND MULTI-LOCUS HAPLOTYPES WITH RECURRENT PREGNANCY LOSS IN WOMEN FROM KAZAKHSTAN

2026

Full text Open access: Hybrid Metadata (CSL-JSON)
DOI 10.34689/sh.2026.28.1.007
Data confidence 85 high
How this score is calculated

It is built from checkable properties of the record itself: whether the article has a DOI, how many independent sources confirmed its data, whether the required fields are filled in, and how recent the latest confirmation is. Disagreement between sources and a missing identifier lower it. A value of 80 or above means the record was published without further checking; 60 to 79 means it is published at reduced confidence, with a manual check advisable. A record verified by an editor by hand is never pushed below 90 by a recalculation. This scores our data about the article, not the article itself.

Abstract

Relevance. Reproductive medicine is still faced with a significant problem of recurrent pregnancy loss (RPL), with over half of diagnoses unexplained. Vitamin D deficiency is linked with poorer pregnancy outcomes and polymorphisms in the vitamin D receptor (VDR) gene can affect reproductive health. Evidence from various populations is not uniform; however, no studies have yet been conducted among women in Central Asia. Objective. The aim of the present study was to examine whether ten common polymorphisms found in the multi-locus haplotypes of the vitamin D receptor (VDR) gene predicted the risk of recurrent pregnancy loss among Kazakhstani women. Materials and methods.These include 200 women with RPL and 200 multiparous healthy controls of the population from the Republic of Kazakhstan. Genotyping of polymorphisms rs739837, rs7975232, rs1544410, rs7975128, rs2228570, rs731236, rs7967152, rs2238140, and rs2853564 was carried out via high-precision real-time PCR. Results. All SNPs analyzed were at Hardy–Weinberg equilibrium among healthy controls. No SNPs indicated associations were found between increased or decreased risk of RPL and minor allele frequencies were not different in RPL cases and controls. Genotype frequencies were also comparable across groups in all conditions (codominant, dominant, recessive, overdominant, log-additive). Using the most common GCCGGAAGA haplotype as a reference (OR = 1.00), haplotype analysis showed a negative association between the TATAGGCAG haplotype and RPL (P = 0.001) at baseline, which was held constant after correcting for major covariates (P = 0.006). In an experimental study, after Bonferroni correction, however, the association was less significant (P = 0.059). Conclusion. We established no significant association between VDR gene polymorphisms and recurrent pregnancy loss among Kazakhstan women. Актуальность. Привычное невынашивание беременности (ПНБ) признано серьезной проблемой в области репродуктивного здоровья, более половины случаев имеют неизвестные причины. Плохой статус витамина D у матери связан с неблагоприятным течением беременности, а мутации в гене VDR могут изменять репродуктивную функцию. Однако доказательства различий между популяциями непоследовательны, и исследования в контексте женщин Центральной Азии еще не проводились. Цель. Данное исследование направлено на оценку потенциальных ассоциаций между десятью общими полиморфизмами и многолокусными гаплотипами гена рецептора витамина D (VDR) и материнским риском повторной потери беременности среди женщин, проживающих в Казахстане. Материалы и методы. Исследование было проведено на основе выборки включавший 200 женщин с ПНБ и 200 многорожавших женщин, составивших контрольную группу из населения Республики Казахстан. Генотипирование полиморфизмов rs739837, rs7975232, rs1544410, rs7975128, rs2228570, rs731236, rs7967152, rs2238140 и rs2853564 проводилось с использованием высокоточной ПЦР в реальном времени. Результаты. Однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs) у здоровых женщин в контрольной группе находились в равновесии Харди-Вайнберга. Ни один из исследованных SNPs не был связан с более высоким или низким риском ПНБ, и частоты минорных аллелей (MAF) не различались у женщин с ПНБ и здоровых женщин. Аналогично, частоты генотипов всех SNPs не варьировались между двумя группами, с учетом соответствующих модификаторов и независимо от используемой генетической модели (кодоминантной, доминантной, рецессивной, сверхдоминантной или лог-аддитивной). Для наиболее распространенного гаплотипа GCCG-GAAGA (OR = 1.00) анализ гаплотипов предполагал отрицательную связь между гаплотипом TATAGGCAG и ПНБ (P = 0.001) изначально, которая сохранялась с учетом важных ковариант (P = 0.006). Однако при контроле на множественные сравнения, проведенные методом Бонферрони, эта ассоциация стала статистически незначимой (P = 0.059). Заключение. Полученные данные демонстрируют, что полиморфизмы гена VDR не были статистически значимо связаны с восприимчивостью к привычному невынашиванию беременности у женщин Казахстана. Өзектілігі. Қайталамалы жүктіліктің үзілуі (ҚЖҮ) — репродуктивті денсаулық саласындағы өзекті мәселелердің бірі болып табылады, әрі оның себептері жағдайлардың жартысынан астамында анықталмаған күйінде қалып отыр. D дәруменінің тапшылығы жүктіліктің қолайсыз нәтижелерімен байланысты, ал D дәрумені рецепторын (VDR) кодтайтын геннің генетикалық вариациялары репродуктивтік функцияға әсер етуі мүмкін. Алайда әртүрлі популяциялар бойынша алынған мәліметтер бір-біріне қарама-қайшы және Орталық Азия әйелдері арасында мұндай зерттеулер бұрын жүргізілмеген. Мақсаты. Қазақстан әйелдері арасында D дәрумені рецепторы (VDR) генінің он кең таралған полиморфизмдері мен көплокусты гаплотиптерінің қайталамалы жүктіліктің үзілу қаупімен ықтимал байланысын анықтау. Материалдар мен әдістері. Зерттеуге ҚЖҮ диагнозы бар 200 әйел және бақылау тобы ретінде 200 көп босанған әйел қатыстырылды. Барлық қатысушылар Қазақстанның әйелдерінен іріктеліп, rs739837, rs7975232, rs1544410, rs7975128, rs2228570, rs731236, rs7967152, rs2238140 және rs2853564 полиморфизмдері нақты уақыттағы ПТР әдісі арқылы жоғары сенімділікпен генотиптелді. Нәтижелері. Барлық зерттелген SNP-тер бақылау тобындағы сау әйелдер арасында Харди–Вайнберг тепе-теңдігіне сай болды. Ешбір полиморфизм ҚЖҮ даму қаупімен немесе оны төмендетумен статистикалық тұрғыдан байланысты болған жоқ. Минорлық аллель жиілігі мен генотиптер үлестері екі топ арасында айтарлықтай айырмашылық көрсетпеді, генетикалық модельдерге (кодоминантты, доминантты, рецессивті, артық-доминантты, лог-аддитивті) қарамастан. Гаплотиптік талдау кезінде ең жиі кездесетін GCCGGAAGA гаплотипі эталон ретінде алынғанда, TATAGGCAG гаплотипі мен ҚЖҮ арасында бастапқыда теріс байланыс байқалды (P = 0,001), бірақ Бонферрони түзетуінен кейін маңыздылығын жоғалтты (P = 0,059 Қорытынды. Зерттеу нәтижелері Қазақстанның әйелдер популяциясында VDR генінің полиморфизмдері мен қайталамалы жүктіліктің үзілу қаупі арасында айқын байланыс жоқ екенін көрсетті.