ELM—the eukaryotic linear motif resource in 2020

Manjeet Kumar, Marc Gouw, Sushama Michael, Hugo Sámano‐Sánchez, Rita Pancsa, Juliana Glavina, Athina Diakogianni, Jesús Alvarado-Valverde, Dayana Bukirova, Jelena Čalyševa

Ещё 4 автора

Nicolás Palópoli, Norman E. Davey, Lucia Beatriz Chemes, Toby J. Gibson

Nucleic Acids Research, 2019

Полный текст Открытый доступ: Gold Метаданные (CSL-JSON)

DOI 10.1093/nar/gkz1030

Достоверность данных 85 высокая

Как считается эта оценка

Складывается из проверяемых признаков самой записи: есть ли у статьи DOI, сколько независимых источников подтвердили её данные, заполнены ли обязательные поля и насколько свежо последнее подтверждение. Снижают оценку расхождения между источниками и отсутствие идентификатора. Значение от 80 означает, что запись опубликована без дополнительной проверки; от 60 до 79 — что она опубликована с пониженной достоверностью и ручная проверка желательна. Запись, выверенную редактором вручную, пересчёт не опускает ниже 90. Это оценка наших данных о статье, а не оценка самой статьи.

Аннотация

The eukaryotic linear motif (ELM) resource is a repository of manually curated experimentally validated short linear motifs (SLiMs). Since the initial release almost 20 years ago, ELM has become an indispensable resource for the molecular biology community for investigating functional regions in many proteins. In this update, we have added 21 novel motif classes, made major revisions to 12 motif classes and added >400 new instances mostly focused on DNA damage, the cytoskeleton, SH2-binding phosphotyrosine motifs and motif mimicry by pathogenic bacterial effector proteins. The current release of the ELM database contains 289 motif classes and 3523 individual protein motif instances manually curated from 3467 scientific publications. ELM is available at: http://elm.eu.org.