Conceptual Model of Clinical and Genetic Relationships for Diagnostics Based on Exome Sequencing

2025

Закрытый доступ Метаданные (CSL-JSON)
DOI 10.1109/ubmk67458.2025.11207017
Достоверность данных 70 средняя
Как считается эта оценка

Складывается из проверяемых признаков самой записи: есть ли у статьи DOI, сколько независимых источников подтвердили её данные, заполнены ли обязательные поля и насколько свежо последнее подтверждение. Снижают оценку расхождения между источниками и отсутствие идентификатора. Значение от 80 означает, что запись опубликована без дополнительной проверки; от 60 до 79 — что она опубликована с пониженной достоверностью и ручная проверка желательна. Запись, выверенную редактором вручную, пересчёт не опускает ниже 90. Это оценка наших данных о статье, а не оценка самой статьи.

Аннотация

The article presents a conceptual model for presenting clinical and genetic relationships derived from conclusions based on the results of whole exome sequencing (WES). The model integrates genetic mutations, phenotypic traits, and clinical diagnoses into an ontologically structured system using international medical classifiers such as HGVS [13], OMIM [11], HPO [12], ClinVar [10], and ICD-10. It supports information extraction from text, semantic annotation, and clinical decision-making. The proposed approach has higher semantic detail, improved integration with biomedical resources, and compatibility with NLP and CDSS tasks. The model was implemented in the OWL 2 ontology language using the Protégé 5.6.5 editor and evaluated with SPARQL queries and ontology metrics tools (OOPS!, OntoMetric).