Conceptual Model of Clinical and Genetic Relationships for Diagnostics Based on Exome Sequencing

2025

Жабық қол жеткізу Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.1109/ubmk67458.2025.11207017
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

The article presents a conceptual model for presenting clinical and genetic relationships derived from conclusions based on the results of whole exome sequencing (WES). The model integrates genetic mutations, phenotypic traits, and clinical diagnoses into an ontologically structured system using international medical classifiers such as HGVS [13], OMIM [11], HPO [12], ClinVar [10], and ICD-10. It supports information extraction from text, semantic annotation, and clinical decision-making. The proposed approach has higher semantic detail, improved integration with biomedical resources, and compatibility with NLP and CDSS tasks. The model was implemented in the OWL 2 ontology language using the Protégé 5.6.5 editor and evaluated with SPARQL queries and ontology metrics tools (OOPS!, OntoMetric).