DNA BARCODING OF THE GENUS TULIPA (LILIACEAE) IN KAZAKHSTAN

2024

Полный текст Открытый доступ: Gold Метаданные (CSL-JSON)
DOI 10.11134/btp.3.2024.6
Достоверность данных 70 средняя
Как считается эта оценка

Складывается из проверяемых признаков самой записи: есть ли у статьи DOI, сколько независимых источников подтвердили её данные, заполнены ли обязательные поля и насколько свежо последнее подтверждение. Снижают оценку расхождения между источниками и отсутствие идентификатора. Значение от 80 означает, что запись опубликована без дополнительной проверки; от 60 до 79 — что она опубликована с пониженной достоверностью и ручная проверка желательна. Запись, выверенную редактором вручную, пересчёт не опускает ниже 90. Это оценка наших данных о статье, а не оценка самой статьи.

Аннотация

DNA barcoding is a reliable and effective tool for analyzing genetic and species diversity. Three plastid genetic markers (rbcL, psbA-trnH, matK) and one nuclear marker (ITS) were amplified with universal primers for species diversity and phylogenetic analysis of eight species including T. greigii, T. kaufmanniana, T. turkestanica, T. bifloriformis, T. patens, T. dubia, T. alberti, T. schrenkii across subgenera Tulipa and Eriostemones in Kazakhstan. DNA samples were obtained from fresh leaves of plants collected from various protected areas of Kazakhstan, and subsequently subjected to PCR, sequencing and deep phylogenetic analysis using Bayesian models for calculating posterior probabilities. Phylogenetic trees generated based on data obtained from individual markers accurately divided the samples into clades representing the subgenera Eriostemones and Tulipa. The ITS marker gave the most reliable results, followed by matK and rbcL; psbA-trnH was the least informative. These finding highlight the importance of using DNA-barcoding markers for comprehensive phylogenetic analysis, and contribute to understanding the genetic diversity and conservation of the Tulipa genus in Kazakhstan.