Molecular identification of Oidium neolycopersici on greenhouse tomato in Kazakhstan

BIO Web of Conferences, 2024

Полный текст Открытый доступ: Gold Метаданные (CSL-JSON)
DOI 10.1051/bioconf/202410003013
Достоверность данных 70 средняя
Как считается эта оценка

Складывается из проверяемых признаков самой записи: есть ли у статьи DOI, сколько независимых источников подтвердили её данные, заполнены ли обязательные поля и насколько свежо последнее подтверждение. Снижают оценку расхождения между источниками и отсутствие идентификатора. Значение от 80 означает, что запись опубликована без дополнительной проверки; от 60 до 79 — что она опубликована с пониженной достоверностью и ручная проверка желательна. Запись, выверенную редактором вручную, пересчёт не опускает ниже 90. Это оценка наших данных о статье, а не оценка самой статьи.

Аннотация

Powdery mildew caused by Oidium neolycopersici is a harmful diseases of tomato widespread all over the world, particularly affecting tomato plants in greenhouses. Despite the occurrence of the disease in Kazakhstan, no studies on molecular identification of the pathogen were conducted to date. In the present work, third generation sequencing of partial rRNA gene sequence was used to identify the isolate of the powdery mildew fungus from a local greenhouse, in addition to traditional identification based on symptoms and micromorphology. As a result, 5,693 reads specific to the target genomic region allowed to obtain a partial consensus sequence rRNA gene of 499 bp length. This sequence was used to identify the fungus. Although the specificity of this sequences was not certain within genera Erysiphe and Pseudoidium, in addition to morphological and pathological traits, it provided sufficient data to identify the found fungal isolate as Oidium [Erysiphe] neolycopersici. More precise identification and characterization require additional studies using purified genetic material of the fungus.