Detection of Lactobacillus species using a gene fragment of the RNA polymerase beta subunit rpoB

Alexandr Shevtsov, Almagul R. Kushugulova, Samat Kozhakhmetov, С. С. Оралбаева, L. G. Stoyanova, Akhan Begmanovich Abzhalelov, Aigerim Seidalina, Kuvat T. Momynaliev

2011

Закрытый доступ Метаданные (CSL-JSON)

DOI 10.3103/s0096392511010093

Достоверность данных 70 средняя

Как считается эта оценка

Складывается из проверяемых признаков самой записи: есть ли у статьи DOI, сколько независимых источников подтвердили её данные, заполнены ли обязательные поля и насколько свежо последнее подтверждение. Снижают оценку расхождения между источниками и отсутствие идентификатора. Значение от 80 означает, что запись опубликована без дополнительной проверки; от 60 до 79 — что она опубликована с пониженной достоверностью и ручная проверка желательна. Запись, выверенную редактором вручную, пересчёт не опускает ниже 90. Это оценка наших данных о статье, а не оценка самой статьи.

Аннотация

In this paper, we report on the comparative analysis of nucleotide sequences of the rpoB gene to assess its potential for use as a genetic marker for identification of Lactibacillus spp. recovered from acid milk products in different regions of Kazakhstan. The discriminatory power of the rpoB gene sequence was shown to be significantly higher for identification of closely related species of the Lactobacillus genus as compared to that of the 16S rRNA gene. The phylogeny based on the rpoB gene proved identical to that of the 16S rRNA gene and could be used as a supplement phylogenetic marker.