Influenza A virus surveillance in domestic pigs in Kazakhstan 2018-2021

G. V. Lukmanova, N. G. Klivleyeva, Т. И. Глебова, N. S. Ongarbayeva, М. Г. Шаменова, N. T. Saktaganov, A. M. Baimukhametova, S. B. Baiseiit, Dariya Ismagulova, Eldar Ismailov

Ещё 2 автора

Galikhan Baisseyev, M. K. Mustafin

2024

Полный текст Открытый доступ: Gold Метаданные (CSL-JSON)

DOI 10.1590/0103-8478cr20230403

Достоверность данных 70 средняя

Как считается эта оценка

Складывается из проверяемых признаков самой записи: есть ли у статьи DOI, сколько независимых источников подтвердили её данные, заполнены ли обязательные поля и насколько свежо последнее подтверждение. Снижают оценку расхождения между источниками и отсутствие идентификатора. Значение от 80 означает, что запись опубликована без дополнительной проверки; от 60 до 79 — что она опубликована с пониженной достоверностью и ручная проверка желательна. Запись, выверенную редактором вручную, пересчёт не опускает ниже 90. Это оценка наших данных о статье, а не оценка самой статьи.

Аннотация

ABSTRACT: This study described the results of a surveillance program monitoring circulation of influenza A viruses among domestic pigs (Sus domesticus) in Kazakhstan during 2018-2021. PCR data derived from 2,513 samples (nasopharyngeal swabs) collected from swine on large pig complexes and peasant farms located in different regions of Kazakhstan revealed that about 5% of samples were positive for influenza A virus RNA. This result suggested low levels of influenza A virus circulation in Kazakhstan. Subtyping of a set of samples revealed that the main strains circulating in 2018-2019 were A/H1N1 and A/H3N2.Surveillance conducted in 2020-2021 identified only A/H1N1 viruses in swine. The PCR data were confirmed by isolation of six strains: five influenza A/H1N1 viruses and one A/H3N2 virus.