Optimization of PCR Purification Using Silica-Coated Magnetic Beads

2020

Полный текст Открытый доступ: Gold Метаданные (CSL-JSON)
DOI 10.11134/btp.1.2020.8
Достоверность данных 70 средняя
Как считается эта оценка

Складывается из проверяемых признаков самой записи: есть ли у статьи DOI, сколько независимых источников подтвердили её данные, заполнены ли обязательные поля и насколько свежо последнее подтверждение. Снижают оценку расхождения между источниками и отсутствие идентификатора. Значение от 80 означает, что запись опубликована без дополнительной проверки; от 60 до 79 — что она опубликована с пониженной достоверностью и ручная проверка желательна. Запись, выверенную редактором вручную, пересчёт не опускает ниже 90. Это оценка наших данных о статье, а не оценка самой статьи.

Аннотация

Purification of nucleic acids is still an important step in molecular genetic research. The development of whole genome sequencing technologies has increased the requirements for the purity of the nucleic acids used, and also required the selection of DNA fragments by size. Buffer systems that contain PEG/NaCl solutions and silica-coated magnetic beads allow to purify nucleic acids and selectively sorb certain sizes of DNA. In this article, we present a simple protocol for the purification of PCR products with the ability to absorb the required DNA molecules. It was determined that the use of an optimized PEG / NaCl buffer system with magnetic silica gel in a ratio of 1.5: 1 with a PCR product allows to get rid of DNA fragments 100 and less base pairs (bp), as well as other contaminants, while maintaining this is more than 90% of the DNA in solution. The ratio of 0.35: 1 allows for high-affinity sorption of DNA molecules larger than 400 bp. The practical use of the obtained data allows us to improve the quality of sequencing without increasing the cost of research.