Genetic polymorphism of 27 Y-STR loci in Kazakh populations from Eastern Kazakhstan

2023

Полный текст Открытый доступ: Gold Метаданные (CSL-JSON)
DOI 10.1080/03014460.2023.2170465
Достоверность данных 70 средняя
Как считается эта оценка

Складывается из проверяемых признаков самой записи: есть ли у статьи DOI, сколько независимых источников подтвердили её данные, заполнены ли обязательные поля и насколько свежо последнее подтверждение. Снижают оценку расхождения между источниками и отсутствие идентификатора. Значение от 80 означает, что запись опубликована без дополнительной проверки; от 60 до 79 — что она опубликована с пониженной достоверностью и ручная проверка желательна. Запись, выверенную редактором вручную, пересчёт не опускает ниже 90. Это оценка наших данных о статье, а не оценка самой статьи.

Аннотация

BACKGROUND: The establishment of a national haplotype database is important for forensic and genetic applications and requires studying genetic polymorphisms at Y-STR sites. However, the genetic structure of the Eastern Kazakhstan population is poorly characterised. AIM: To investigate the genetic polymorphisms of 27 Y-STR loci in the Kazakh population from Eastern Kazakhstan and analyse the population genetic relationships of the Eastern Kazakhs with other populations. SUBJECTS AND METHODS: The Yfiler Plus kit was utilised to genotype 246 healthy, unrelated males from Eastern Kazakhstan. Based on the raw data, haplotype and allele frequencies along with forensic parameters were calculated, and an MDS plot was constructed. RESULTS: A total of 207 haplotypes were detected, of which 186 were unique. The haplotype diversity and discrimination capacity were 0.997 and 0.841, respectively. Population comparisons showed that Eastern Kazakhs have close genetic relationships with Kazakhs from Xinjiang, China. At the same time, a difference was found between the studied population and the previous one in the same part of Kazakhstan. CONCLUSIONS: The obtained haplotypes will help to expand the Kazakhstan Y-chromosome reference database and will be useful for future genetic research and forensic applications.