Assessment of the effectiveness of ITS markers in DNA barcoding of Betula species in the Kazakh Altai

2025

Полный текст Открытый доступ: Gold Метаданные (CSL-JSON)
DOI 10.32523/2616-7034-2025-150-1-7-21
Достоверность данных 70 средняя
Как считается эта оценка

Складывается из проверяемых признаков самой записи: есть ли у статьи DOI, сколько независимых источников подтвердили её данные, заполнены ли обязательные поля и насколько свежо последнее подтверждение. Снижают оценку расхождения между источниками и отсутствие идентификатора. Значение от 80 означает, что запись опубликована без дополнительной проверки; от 60 до 79 — что она опубликована с пониженной достоверностью и ручная проверка желательна. Запись, выверенную редактором вручную, пересчёт не опускает ниже 90. Это оценка наших данных о статье, а не оценка самой статьи.

Аннотация

This study investigates the effectiveness of ITS (Internal Transcribed Spacer) DNA barcoding markers for identifying and differentiating eight species of Betula within the Kazakh Altai flora: Betula glandulosa, B. pendula, B. pubescens, B. rotundifolia, B. rezniczenkoana, B. tianschanica, B. microphylla, and B. kirghisorum. By extracting and sequencing DNA from herbarium specimens, the study focuses on assessing the genetic diversity and resolving phylogenetic relationships among these Betula species, many of which have close morphological similarities that can complicate traditional taxonomy. The results reveal that ITS markers provide clear genetic differentiation between these species, highlighting the effectiveness of ITS in distinguishing even closely related species within the Betula genus. Analysis using the Neighbor-Joining method showed two primary clusters, aligning well with known phylogenetic sections, Apterocaryon and Betula, which are established classifications within the genus. Furthermore, the study offers the first ITS sequence data for two species, B. rezniczenkoanaand B. kirghisorum, contributing new genetic information to the NCBI database. These findings are crucial for ongoing conservation efforts, given the ecological and environmental pressures facing native Betula species in the Kazakh Altai. By providing reliable molecular markers, this research supports future studies on species distribution, genetic diversity, and conservation planning within this biodiverse and ecologically sensitive region.