HAT-RAPD profiling of seven fungi isolated from central Kazakhstan soils

2014

Жабық қол жеткізу Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.38150/sajeb.4(1).p17-23
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Stable HAT-RAPD (high annealing temperature) profiles were obtained for 7 micromycetes isolated from the central Kazakhstan soils with single non-specific primers. An arbitrary primer (decamer AP3), a primer derived from the intergenic spacer regions (T3B) and microsatellite primer (GTG)5 were applied in PCR. Precise and reproducible profiles of the amplification prod-ucts were obtained for all seven hyphomycetes isolates in spite of increased annealing temperature application. The number and size of amplicons reflect a species specificity. In some cases intraspecific variability was observed. Cluster analysis of the profiles demonstrated the phylogenetic relationships between isolates that are consistent with those of ITS-region genotyping. Obtained results completely justify the application of the HAT-RAPD in mark-ing and rapid identification of soil hyphomycetes.