Molecular monitoring and multiplex qPCR-based detection of Cydia pomonella and Grapholita molesta in apple orchards of Kazakhstan

Frontiers in Insect Science, 2026

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Gold Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.3389/finsc.2026.1897268
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Introduction Apple production in Kazakhstan is highly vulnerable to damage caused by fruit-infesting tortricid pests, particularly codling moths (Lepidoptera: Tortricidae). Accurate and rapid species identification is essential for effective pest management and phytosanitary monitoring in apple orchards. Methods Field surveys were conducted in apple orchards of southern and southeastern Kazakhstan to investigate the codling moth complex. Collected specimens were identified morphologically and confirmed by sequencing a mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) region. Comparative COI sequence analysis was used to develop a multiplex quantitative polymerase chain reaction assay employing Minor Groove Binder hydrolysis probes for simultaneous detection and differentiation of Cydia pomonella and Grapholita molesta . Results Field surveys identified C. pomonella and G. molesta , with C. pomonella accounting for 83.3% of collected specimens. COI sequencing enabled reliable discrimination between the two species. The multiplex assay demonstrated high specificity, produced no false-positive amplification in non-target species, and achieved 100% detection down to 5 pg DNA per reaction. Discussion The developed COI-based multiplex quantitative polymerase chain reaction assay provides a rapid, sensitive, and reliable tool for simultaneous identification of C. pomonella and G. molesta . It is suitable for phytosanitary monitoring, early detection, and management of quarantine-relevant tortricid pests in Kazakhstan.