ANALYSIS OF THE BACTERIAL MICROBIOME OF CASPIAN SEALS (PUSA CASPICA) THROUGH SHOTGUN METAGENOMIC SEQUENCING

2024

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Gold Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.53729/mv-as.2024.03.07
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

The Caspian seal (Pusa caspica), found only in the Caspian Sea, plays a crucial role in its ecosystem as both a primary piscivore and a fundamental environmental indicator. However, Caspian seals face threats from human activities and pathogenic infections. In this study, shotgun metagenomic sequencing was utilized to investigate the bacterial communities present in nasal, buccal, rectal, and urogenital swabs from adult female Caspian seals. The results demonstrated a diverse microbiome of Caspian seals, predominantly composed of Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria, Firmicutes, and Fusobacteria, with each sample type harboring distinct bacterial genera. Additionally, the study identified key pathogenic bacteria in specific sample types: Brucellawas detected exclusively in urogenital samples, Leptospira was widespread in buccal and nasal samples, and Mycobacterium was prevalent in buccal and urogenital samples. These insights enhance our understanding of Caspian seals' health, highlighting the importance of microbial diversity in their physiology and survival. This knowledge is critical for the conservation of Caspian seals, particularly in emergencies affecting their population, and for developing effective rehabilitation strategies. Каспийский тюлень (Pusa caspica), обитающий исключительно в Каспийском море, играет ключевую роль в своей экосистеме как основной рыбоядный и важный экологический индикатор. Однако каспийские тюлени находятся под угрозой из-за антропогенных факторов и патогенных инфекций. В этом исследовании с помощью метагеномного секвенирования методом дробовика изучен бактериальный состав проб, взятых из носовых, ротовых, ректальных и мочеполовых мазков у взрослых самок каспийских тюленей. Результаты показали разнообразный микробиом, представленный преимущественно Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria, Firmicutes и Fusobacteria, причем каждый тип образца содержал уникальные бактериальные роды. Кроме того, исследование выявило ключевые патогенные бактерии в определенных типах проб: Brucellaбыла обнаружена исключительно в мочеполовых образцах, Leptospira широко распространена в ротовых и носовых пробах, а Mycobacterium преобладал в ротовых и урогенитальных смывах. Эти результаты расширяют наше понимание здоровья морских млекопитающих и подчеркивают важность микробного разнообразия для их физиологии и выживания. Эти знания имеют критическое значение для сохранения вида, особенно при возникновении чрезвычайных ситуаций в популяции каспийских тюленей и разработки эффективных стратегий их реабилитации.