Аңдатпа
Микробиом кишечника влияет на физиологию, метаболизм, и иммунную функцию хозяина и обеспечивает непрямую (иммуноопосредованные) и прямую устойчивость к кишечным патогенам. Нами был исследован микробиом крупного рогатого скота при помощи метода 16S метаборкодирования. Результаты анализировали биоинформатическим методом. В результате проведенных исследований было установлено, что наблюдаются статистически достоверные различия в микробиоме животных различных регионов и с разными условиями содержания. Так у животных стойлового содержания преобладали классы Gammaproteobacteria и Actinobacteria, а у пастбищных - Clostridia. Класс Gammaproteobacteria также преобладал в содержимом фекалий крупного рогатого скота юго-восточного региона. Таким образом, на микробиому крупного рогатого скота влияют условия содержания и географическое расположение животных. В результате проведенных экспериментов было установлено, что количество архей было выше в фекалиях коров северного региона и составило 1,46 против 0,22 юго – восточного региона (P >0,99). Анализ данных в стойловый период показал, что количество архей выше в фекалиях коров западного региона и составило 0,35 против 0,01 в восточном регионе (P >0,99). В результате сравнительного анализа данных в стойловый период установлено, что количество архей было выше в фекалиях коров западного региона и составило 0,28 против 0,02 юго-восточного региона (P >0,99). Пастбищное содержание животных, увеличивает относительное количество метаногенов семейств Methanobacteriaceae, Methanocorpuscolaceae, Methanosarcinaceae, Methanomethylophilaceae, которые выделяют большее количество метана. Для уменьшения выбросов эмиссии метана рекомендуем пастбищных животных вечером подкармливать концентратами.