Hypocretin/orexin system genes HCRT, HCRTR1 and HCRT2polymorphisms in “sleeping sickness” in Kazakhstan

2022

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Green Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.21203/rs.3.rs-1608901/v1
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Abstract Background: The cause of “sleeping sickness”, which struck many residents of Kalachi settlement in 2013-2015, has still not been identified, despite the efforts of Kazakh scientists. Some unknown factor X, causing sleeping sickness, appears likely to affect people. We assumed that polymorphism in the genes of the orexinoergic system, which is the most important mechanism in sleep/awakening regulating, can determine individual susceptibility to factor X. Methods: To test this hypothesis, we conducted a case-control study of polymorphisms in genes which has shown to have previously been associated with nervous disorder HCRT (rs760282), HCRTR1 (rs2271933) and HCRTR2 (rs2653349 and rs3122156).Results: Of the four polymorphisms tested, only rs2653349 showed association with sleeping sickness in both the common sample and the sample of Russian. However, despite association discovered, due to the lack of homozygote on minor allele A in the test group we cannot point it out as a risk for a “sleeping sickness”. Instead, we point out a risky heterozygote genotype (GA (OR = 3.94, 95%CI = 1.43 – 10.88, codominant model, p = 0.0011).Conclusions: When the sample is divided by sex, relation between rs2653349 and “sleeping sickness” appeared only in the female sample (OR = 3.82, 95%CI = 1.05 – 13.94, codominant model, p = 0.0037).