Genetic characterization of a new candidate hemagglutinin subtype of influenza A viruses

Emerging Microbes & Infections, 2023

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Gold Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.1080/22221751.2023.2225645
Деректер сенімділігі 85 жоғары
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Avian influenza viruses (AIV) have been classified on the basis of 16 subtypes of hemagglutinin (HA) and 9 subtypes of neuraminidase. Here we describe genomic evidence for a new candidate HA subtype, nominally H19, with a large genetic distance to all previously described AIV subtypes, derived from a cloacal swab sample of a Common Pochard (Aythya ferina) in Kazakhstan, in 2008. Avian influenza monitoring in wild birds especially in migratory hotspots such as central Asia is an important approach to gain information about the circulation of known and novel influenza viruses. Genetically, the novel HA coding sequence exhibits only 68.2% nucleotide and 68.5% amino acid identity with its nearest relation in the H9 (N2) subtype. The new HA sequence should be considered in current genomic diagnostic AI assays to facilitate its detection and eventual isolation enabling further study and antigenic classification.