ASAR Database: An R Tool for Visual Analysis and Storage of Metagenomes

Askarbek N Orakov, Nazgul Sakenova, Igor Goryanin, Anatoly Sorokin

2018

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Hybrid Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.5220/0006722801960200
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

The functional and taxonomic analysis is the critical step in understanding the interspecies interaction within the microbial communities. Currently, these types of analysis are run independently, which makes interpretation of the results hard and error-prone. Here we present ASAR (Advanced metagenomic Sequence Analysis in R) Database, the interactive tool and the databases for storage and exploratory analysis of the metagenomic sequencing data along three dimensions: taxonomy, function, and environmental conditions.