Comparison Between O and OH Intermediates of Cytochrome c Oxidase Studied by FTIR Spectroscopy

2020

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Gold Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.3389/fchem.2020.00387
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Abstract Cytochrome c oxidase is terminal enzyme in the respiratory chain of mitochondria and many aerobic bacteria. It catalyzes reduction of oxygen to water. During its catalysis, C c O proceeds through several quite stable intermediates ( R , A , P R/M , O/O H , E/E H ). This work is concentrated on the elucidation of the differences between structures of oxidized intermediates O and O H in different C c O variants and at different pH values. Oxidized intermediates of wild type and mutated C c O from Paracoccus denitrificans were studied by means of static and time-resolved Fourier-transform infrared spectroscopy in acidic and alkaline conditions in the infrared region 1800-1000 cm -1 . No reasonable differences were found between all variants in these conditions, and in this spectral region. This finding means that the binuclear center of oxygen reduction keeps a very similar structure and holds the same ligands in the studied conditions. The further investigation in search of differences should be performed in the 4000-2000 cm -1 IR region where water ligands absorb. Abbreviations A ferrous-oxy intermediate ATR Attenuated total reflectance BG background BNC binuclear center C c O Cytochrome c oxidase E one-electron reduced intermediate F ferryl intermediate FRCO fully-reduced CO-inhibited enzyme FTIR Fourier transform infrared IR infrared NHE Normal Hydrogen Electrode N-side negatively charged side of the membrane P R/M “peroxy” intermediates; P-side positively charged side of the membrane R fully-reduced intermediate TR time-resolved WT wild type