Predicting cytotoxicity of engineered nanoparticles using regularized regression models: an in silico approach

2023

Жабық қол жеткізу Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.1080/1062936x.2023.2242785
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

The widespread application of engineered nanoparticles (NPs) in various industries has demonstrated their effectiveness over the years. However, modifications to NPs' physicochemical properties can lead to toxicological effects. Therefore, understanding the toxicity behaviour of NPs is crucial. In this paper, regularized regression models, such as ridge, LASSO, and elastic net, were constructed to predict the cytotoxicity of various engineered NPs. The dataset utilized in this study was compiled from several journals published between 2010 and 2022. Data exploration revealed missing values, which were addressed through listwise deletion and kNN imputation, resulting in two complete datasets. The ridge, LASSO, and elastic net models achieved F1 scores ranging from 91.81% to 92.65% during internal validation and 92.89% to 93.63% during external validation on Dataset 1. On Dataset 2, the models attained F1 scores between 92.16% and 92.43% during internal validation and 92% and 92.6% during external validation. These results indicate that the developed models effectively generalize to unseen data and demonstrate high accuracy in classifying cytotoxicity levels. Furthermore, the cell type, material, cell source, cell tissue, synthesis method, and coat or functional group were identified as the most important descriptors by the three models across both datasets.