Advancing precision single-cell analysis of red blood cells through semi-supervised deep learning using database of patients with post-COVID-19 syndrome

2024

Жабық қол жеткізу Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.1117/12.3008410
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

We developed a semi-supervised deep-learning-based system classifying different types of red blood cells (RBCs) images based on their shape, texture, and size. Specifically, pre-training a convolutional neural network was done on over 35,000 brightfield images of RBCs acquired with an imaging flow cytometer from a post-COVID-19 patient cohort. The system utilizes object localization powered by a YOLO-inspired block for cell identification and a de-blurring CNN block based on FocalNet. A series of convolutional and fully connected layers classifies images into side-view, biconcave, elongated, and additional categories for reticulocytes and erythrocytes. Fine-tuning was done using 7,000 manually labeled brightfield images. Consequent evaluation on a test dataset of 3,000 samples yielded an accuracy of 98.2%. This system can be used for other cell analysis tasks, not requiring large fine-tuning datasets while maintaining high efficiency.