Isolation and characterization of 15 SSR loci for the endangered European tetraploid species Gladiolus palustris (Iridaceae)

2019

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Gold Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.1002/aps3.1245
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Premise Gladiolus palustris (Iridaceae) is an endangered European perennial tetraploid herb with special conservation interest in the European Union. Microsatellite markers can serve as effective tools for the conservation genetics of this species. Methods and Results We utilized a 454 pyrosequencing approach to identify simple sequence repeat (SSR) regions in a microsatellite‐enriched library. Of all SSR regions, 46 were screened for specific PCR amplification, and 15 were found to be applicable in the target species. We found 1.62–3.08 alleles per population (effective alleles: 1.58–2.08) that indicated moderate to high genetic diversity values (0.28–0.44) in three pilot populations. Cross‐species amplification was less effective in G. imbricatus and G. tenuis. Conclusions The primers reported here can be used for the population genetic characterization of G. palustris. They will help us to better understand the conservation genetics of this highly endangered species.