GWAS for QTLs associated with agronomic traits in Chickpea (Cicer arietinum L.) harvested in South-East Kazakhstan

2025

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Gold Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.1186/s12870-025-07749-3
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Chickpea ( Cicer arietinum L.) is vital for global food security; however, its productivity is limited by genotype-environment interactions and restricted genetic diversity. This study dissected the genetic architecture of six agronomic traits in chickpea using genome-wide association studies (GWAS) to identify stable quantitative trait loci (QTLs). Phenotypic analysis of 238 chickpea accessions across three growing seasons revealed significant variation in plant height (PH), height to lowest pod (HLP), number of lateral branches (NLB), number of seeds per plant (NSP), thousand-seed weight (TSW), and yield per plant (YP). Broad-sense heritability ( h 2 ) ranged from 0.15 (NSP) to 0.88 (TSW). GWAS identified 40 stable QTLs, including major-effect loci on chromosomes 2 ( Q_YP_2.1 , R ² = 0.45) and 4 ( Q_TSW_4.1 , R ² = 0.22). Candidate genes linked to polyamine biosynthesis (LOC101508792) and carbohydrate metabolism (LOC101492955) were implicated. The study highlights the potential of marker-assisted selection for enhancing chickpea resilience and productivity, particularly in drought-prone regions such as Kazakhstan.