Distribution of Wheat-Infecting Viruses and Genetic Variability of Wheat Streak Mosaic Virus and Barley Stripe Mosaic Virus in Kazakhstan

Anastasiya Kapytina, Mariya Kolchenko, Nazym Kerimbek, Alexandr S. Pozharskiy, Гулназ Низамдинова, Aisha Taskuzhina, Kamila Adilbayeva, Marina Khusnitdinova, Malika Amidullayeva, Ruslan Moisseyev

Тағы 2 автор

Zulfiya Kachiyeva, Dilyara Gritsenko

2024

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Gold Метадеректер (CSL-JSON)

DOI 10.3390/v16010096

Деректер сенімділігі 70 орташа

Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Wheat is an essential cereal crop for the economy and food safety of Kazakhstan. In the present work, a screening of wheat and barley from different regions of Kazakhstan was conducted using newly developed specific primers for reverse transcription PCR and loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assays. In total, 82 and 19 of 256 samples of wheat and barley tested positive for wheat streak mosaic virus (WSMV) and barley stripe mosaic virus (BSMV), respectively. A phylogenetic analysis using two independent methods revealed that most of the analyzed isolates had a European origin. Molecular data on the distribution and diversity of cereal viruses in Kazakhstan were obtained for the first time and will help lay a foundation for the implementation of genetics and genomics in wheat phyto-epidemiology in the country.