miR-1279, miR-548j, miR-548m, and miR-548d-5p Binding Sites in CDSs of Paralogous and OrthologousPTPN12,MSH6, andZEB1Genes

2013

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Hybrid Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.1155/2013/902467
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Only PTPN12, MSH6, and ZEB1 have significant miR-1279 binding sites among paralogous genes of human tyrosine phosphatase family, DNA mismatch repair family, and zinc finger family, respectively. All miRNA binding sites are located within CDSs of studied mRNAs. Nucleotide sequences of hsa-miR-1279 binding sites with mRNAs of human PTPN12, MSH6, and ZEB1 genes encode TKEQYE, EGSSDE, and GEKPYE oligopeptides, respectively. The conservation of miRNA binding sites encoding oligopeptides has been revealed. MRNAs of many paralogs of zinc finger gene family have from 1 to 12 binding sites coding the same GEKPYE hexapeptide. MRNAs of PTPN12, MSH6, and ZEB1 orthologous genes from different animal species have binding sites for hsa-miR-1279 which consist of homologous oligonucleotides encoding similar human oligopeptides TKEQYE, EGSSDE, and GEKPYE. MiR-548j, miR-548m, and miR-548d-5p have homologous binding sites in the mRNA of PTPN12 orthologous genes which encode PRTRSC, TEATDI, and STASAT oligopeptides, respectively. All regions of miRNA are important for binding with the mRNA.