Peer Review Report For: Complete chloroplast genomes of endemic Astragalus and Oxytropis species from Uzbekistan [version 1; peer review: 2 approved with reservations]

2026

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Gold Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.5256/f1000research.196779.r473037
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Chloroplast genomes provide important insights into plant phylogeny, genome evolution, and molecular marker development. In this study, we sequenced, assembled, and analyzed the complete chloroplast genomes of two endemic species from Uzbekistan, Astragalus nuratensis and Oxytropis pseudorosea. Genome skimming generated high-quality paired-end reads, enabling the recovery of complete plastomes with mean sequencing depths of 638× and 1,725×, respectively. The chloroplast genomes were 122,316 bp in A. nuratensis and 122,708 bp in O. pseudorosea. Both genomes encoded 110 unique genes, including 76 protein-coding genes, 30 transfer RNA genes, and 4 ribosomal RNA genes. Consistent with members of the inverted repeat–lacking clade of Fabaceae, both species lacked the typical inverted repeat regions, resulting in a single-copy genome structure. Phylogenetic analysis based on 119 complete chloroplast genomes resolved major lineages within Astragalus and related genera with strong support. Astragalus nuratensis was placed within the Phaca clade, while Oxytropis pseudorosea formed part of a distinct Oxytropis lineage. These results provide new genomic resources for understanding evolutionary relationships and plastome evolution in Central Asian legumes.