Optimization of cell annotation process: combining manual and automatic labeling in biomedical data analysis optoelectronic systems

2025

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Green Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.1117/12.3096280
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Modern biomedical research requires highly accurate and scalable image annotation, especially when working with cryomicroscopic data. One of the key stages in analyzing such images is the annotation of cellular structures, which is essential for training machine learning models. This paper explores an approach to optimizing the process of cell annotation by combining manual and automatic labeling within the CVAT (Computer Vision Annotation Tool) environment. The proposed method integrates the precision of manual annotation with the efficiency of automated segmentation algorithms, significantly reducing labor costs and improving reproducibility. During the study, the capabilities of CVAT were analyzed, built-in automated tools were tested, and scenarios for their combined use with manual corrections were described. The advantages of the hybrid approach, common errors, and ways to minimize them are discussed. The results demonstrate that combined annotation enables faster preparation of training datasets without significant loss of quality, especially when working with large volumes of images. This approach may be beneficial for automated biomedical data analysis systems where rapid scaling is required without compromising accuracy.