A coumarin-30-based method for identification of tubulin ligands with diverse binding sites

2025

Толық мәтін Ашық қол жеткізу: Green Метадеректер (CSL-JSON)
DOI 10.26434/chemrxiv-2025-dqlc5
Деректер сенімділігі 70 орташа
Бұл баға қалай есептеледі

Ол жазбаның өзінің тексерілетін белгілерінен құралады: мақаланың DOI-і бар ма, оның деректерін қанша тәуелсіз дереккөз растады, міндетті өрістер толтырылған ба және соңғы растау қаншалықты жаңа. Дереккөздер арасындағы алшақтық пен идентификатордың болмауы бағаны төмендетеді. 80-нен бастап мән жазбаның қосымша тексерусіз жарияланғанын, 60-тан 79-ға дейін — оның сенімділігі төмен күйде жарияланғанын және қолмен тексеру ұсынылатынын білдіреді. Редактор қолмен тексерген жазбаны қайта есептеу 90-нан төмен түсірмейді. Бұл — мақаланың өзіне емес, ол туралы деректерімізге берілген баға.

Аңдатпа

Tubulins are among the most successful targets for cancer chemotherapy. However, the emergence of drug resistance stimulates the continuous search for novel chemotherapeutics. Here, we discover that coumarin-30, a widely available laser dye, binds to the colchicine site of tubulin and inhibits microtubule dynamics and cancer cell division at submicromolar concentrations. By combining coumarin-30 as a fluorescent probe with the microscale thermophoresis approach, we develop a versatile assay for detecting tubulin–ligand interactions and simultaneously sorting ligands into binders of the colchicine site versus other protein pockets. The assay’s performance is demonstrated on a wide panel of compounds. Using this methodology, we identify several potent tubulin polymerization inhibitors and determine their binding sites. The results are verified with studies of microtubule dynamics in vitro and the cell cycle in cancer cell culture. Thus, the coumarin-30-based assay is a fast, accurate, and cost-effective method for characterizing tubulin ligands with diverse binding pockets.